SNP分子标记

SNP标记是美国学者Lander E于1996年提出的第三代DNA遗传标记。SNP是指同一位点的不同等位基因之间仅有个别核苷酸的差异或只有小的插入、缺失等。从分子水平上对单个核苷酸的差异进行检测,SNP 标记可帮助区分两个个体遗传物质的差异。

SNP适于快速、规模化筛查。组成DNA的碱基虽然有4种,但SNP一般只有两种碱基组成,所以它是一种二态的标记,即二等位基因(biallelic)。 由于SNP的二态性,非此即彼,在基因组筛选中SNPs往往只需+/-的分析,而不用分析片段的长度,这就利于发展自动化技术筛选或检测SNPs。

SNP是single nucleotide polymorphism 的缩写,是指在基因组上单个核苷酸的变异,形成的遗传标记,其数量很多,多态性丰富。指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。SNP在基因组中分布相当广泛,近来的研究表明在人类基因组中每300碱基对就出现一次。

SNP是分布在动物基因组中非常常见的一种分子标记。在人体中每1000bp就可能有一个SNP。需找SNP的目的是为了做连锁分析,在现在先进的技术里,还可以做全基因组关联分析(GWAS)。

三)、分子信标技术与Taqman技术相似,分子信标技术也是在PCR反应体系种加入荧光标记的探针与靶序列杂交,通过仪器检测荧光值的变化,进行基因分型。优缺点:分子信法在选择荧光染料时,不必像Taqman法那样考虑染料之间光谱的重叠性,一次可以使用4种或4种以上染料,同时对多个SNP进行分析。

大肠杆菌O157:H7的E.coliO157:H7的检验

我国已陆续有十余个省份在市售食品、进口食品、腹泻病患者、家畜家禽等分离到大肠杆菌O157:H7。

动物来源的食物,如牛肉、鸡肉、牛奶、奶制品等是O157H7大肠杆菌经食物传播的主要因素,尤其是在动物屠宰过程中这些食物更易受到寄生在动物肠道中的细菌污染。另外蔬菜、水果等被O157H7大肠杆菌污染也可造成大肠杆菌感染爆发。

目前检测出最多的样本主要是一些生吃蔬菜,如黄瓜、豆苗、生菜、卷心菜等,及其制成的沙拉。

是一种两端钝圆、能运动、无芽孢的革兰氏阴性短杆菌。大肠杆菌能合成维生素B和K,正常栖居条件下不致病;若进入胆囊、膀胱等处可引起炎症。在水和食品中检出,可认为是被粪便污染的指标。大肠菌群数常作为饮水、食物或药物的卫生学标准。

肠出血性大肠杆菌:肠出血性大肠杆菌可在7℃-50℃的温度中生长,其最佳生长温度为37℃。大肠杆菌O157:最适生长温度为33-42℃,37℃繁殖迅速,44-45℃生长不良,45℃停止生长。

肠出血性大肠杆菌(enterohemorrhagic Es-cherichia coli,EHEC)是一类重要的肠道致病菌,它可引起腹泻、出血性结肠炎(HC)、溶血性尿毒综合征(HUS)、血栓性血小板减少性紫癜(TTP)等疾病,严重者可导致死亡。这一病菌已在世界不同地区多次暴发,其中以O157∶H7血清型为其代表菌株。

比较一下化学分子结构,了解药效。

1、电泳:核苷酸、核酸均可以进行电泳,泳动速度主要由分子大小来决定,因此,电泳是测定核酸分子量的好方法。DNA分子量测定最直接的方法:用适当浓度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以将其他形式的DNA变成线形DNA,用电镜测出其长度,按B-DNA模型算出bp数,根据核苷酸的平均分子量就可计算出DNA的分子量。

2、四环素眼膏的主要成分是具有特定化学结构的药物。其精确的化学名称为:6-甲基-4-(二甲氨基)-3,6,10,12,12a-五羟基-1,11-二氧代-1,4,4a,5,5a,6,11,12a-八氢-2-并四苯甲酰胺,这个复杂的名称揭示了其分子的精细结构。

3、司帕沙星是一种具有特定化学结构的药物,其详细名称为5-氨基-1-环丙基-7-(顺式-3,5-二甲基-1-哌嗪基)-6,8-二氟-1,4-二氢-4-氧代-哇啉-3-羟酸。这一复杂的名字反映了其分子构成,它由碳(C)、氢(H)、氟(F)、氮(N)和氧(O)等元素组成。

4、卤素:/卤素,特别是氟原子和三氟甲基,就像化学版的超级电荷,它们通过改变分子电荷分布,增强与受体的电性结合,从而增强药物的作用强度。例如,奋乃静和氟奋乃静的区别,就清晰展示了这一点。在苯环上引入卤素,还能提升药物的脂溶性,使其在体内分布更广。

5、化学结构图是表示化学分子中原子和化学键的图形。它通常由原子和化学键组成,有时还会包括分子式、离子符号、电子云等元素。要了解化学结构图的基本构成元素。在化学结构图中,每个球形代表一个原子,而线条则代表化学键。原子和化学键的不同组合方式,构成了不同的分子结构。

6、樟脑(camphor)化学名为莰酮-[2],分子式为C10H16O,分子结构为立体结构。由樟树木片用水蒸气蒸馏所得的精油,系白色晶体。从樟树的树皮与木质蒸馏制得的酮,也可从松节油合成。用于许多商品的制备,临床上可作为局部抗炎和止痒涂剂。根据原料和加工方法,有天然樟脑和合成樟脑两种。

AlexaFluor系列染料光谱特性

Alexa Fluor系列荧光染料以其独特的光谱特性在生物学研究中广泛应用。其中,Alexa Fluor 350发出亮蓝色荧光,其波长较AMCA短,易于与绿色荧光区分。Alexa Fluor 405几乎完美匹配蓝色二极管激光器,其发射/激发波长为402/421nm,适用于荧光显微镜和流式细胞仪。

Alexa Fluor 532——最适于532nm激发光源的染料激发发射波长位于绿色荧光Alexa Fluor 488和橙色荧光的Alexa Fluor 546之间,适用于双频Nd:YAG激光器在内的532 nm激发光源。

Alexa Fluor系列染料是荧光标记领域的一项重要创新,它提供了一系列覆盖近紫外、可见光和近红外光谱的高效染料。这些染料的独特之处在于它们生产的偶联物在实验中被证实为最亮且性能卓越,尤其在蓝光和远红光的检测范围内,为多色检测和荧光共振能量转移(FRET)技术提供了丰富的选择。

Alexa Fluor系列染料以其独特的优点在荧光标记领域表现出色。首先,其亮度显著优于同类产品,展现出极强的荧光效果,使得图像信号更加鲜明,便于观察和分析。其次,光稳定性是Alexa Fluor的一大亮点。

脱氧核糖核酸的主要类别

1、脱氧核糖核酸(DNA)的主要类别包括单链DNA和双链DNA。 单链DNA:大部分DNA以双螺旋结构存在,但一经热或碱处理就会变为单链状态。单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。 双链DNA:在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面,单链DNA与双链DNA不同。

2、脱氧核糖核苷酸有四种。脱氧核苷酸是核酸的组成单位,它与核糖核苷酸相对应。脱氧核苷酸主要包括四种类型,分别为腺嘌呤脱氧核苷酸、鸟嘌呤脱氧核苷酸、胞嘧啶脱氧核苷酸和胸腺嘧啶脱氧核苷酸。这些核苷酸以磷酸酯连接,通过一系列复杂的过程参与生物体的遗传信息表达和生命活动调控。

3、每一种脱氧核糖核苷酸由三个部分所组成:一分子含氮碱基+一分子五碳糖(脱氧核糖)+一分子磷酸根。核酸的含氮碱基又可分为四类:腺嘌呤(adenine,缩写为A),胸腺嘧啶(thymine,缩写为T),胞嘧啶(cytosine,缩写为C)和鸟嘌呤(guanine,缩写为G)。DNA的四种含氮碱基组成比例具有物种特异性。

4、一分子脱氧核糖、一分子磷酸和一分子含氮碱基。其中前两部分都一致,第三部分的含氮碱基有四种分类,分别是:腺嘌呤 (adenine,缩写为A)胸腺嘧啶(thymine,缩写为T)胞嘧啶(cytosine,缩写为C)鸟嘌呤(guanine,缩写为G)——通过其排列顺序的不同,记录了各种各样的遗传信息。

分子杂交技术的几种常见的杂交

1、Southern杂交:DNA片段经电泳分离后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜或尼龙膜上,然后与探针杂交。被检对象为DNA,探针为DNA或RNA。(2) Northern杂交:RNA片段经电泳后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜上,然后用探针杂交。被检对象为RNA,探针为DNA或RNA。

2、常见的杂交技术包括Southern、Northern、斑点、狭槽和菌落杂交。Southern杂交针对DNA片段,涉及酶切、电泳转移、预杂交、杂交和显影过程,信号强度受DNA比例和探针活性影响。转移方法有毛细管、电泳和真空转移,各有优缺点。

3、分子杂交的方法:Southern杂交、Northern杂交、菌落原位杂交、斑点杂交。互补的核苷酸序列通过Watson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。

4、问题二:分子杂交技术的几种常见的杂交 分子杂交是通过各种方法将核酸分子固定在固相支持物上,然后用放射性标记的探针与被固定的分子杂交,经显影后显示出目的DNA或RNA分子所处的位置。

5、常用的固相杂交类型有:菌落原位杂交、斑点杂交、狭缝杂交、Southern印迹杂交、Northern印迹杂交、组织原位杂交和夹心杂交等。(2)液相杂交 所参加反应的两条核酸链都游离在溶液中,一种研究最早且操作复合的杂交类型,在过去的30年里虽有时被应用,但总不如固相杂交那样普遍。

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