1、免疫组库的测序原理基于高通量测序技术,一次性获得大量单细胞的基因表达谱和免疫组库数据,实现单细胞分辨率上的基因转录本和免疫组库的高通量测序。以下是免疫组库构建的详细步骤: 在B细胞或T细胞中,V(D)J区段位于mRNA的5端,以便捕获全长序列。
2、单细胞测序方法和原理系列:免疫组库(immune repertoire, IR)是指某个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和,在自身免疫疾病、传染病、癌症等多种疾病中扮演者至关重要的角色,也正因此免疫组库一直是各领域的研究重点。
3、参考资料包括labex:了解单细胞测序第五课——单细胞免疫组库、单细胞免疫组库VDJ——基础知识(一)和单细胞免疫组库:TCR基因重排原理和TCR测序建库方法 - 简书 (jianshu.com)。
1、TCR测序技术的出现,旨在捕捉T细胞在细胞免疫反应中的作用。此技术在科研与临床应用中具有重要价值,尤其是在构建免疫组库与过继细胞回输(TCR-T Cell)方面。免疫组库(IR)包括循环系统内所有功能性T细胞和B细胞的总和,分为B细胞受体库、T细胞受体库和抗体组库。
2、高通量测序技术使得TCR库研究成为可能。通过TCR序列分析,可以深入理解免疫相关疾病的发展,以及设计更有效的治疗靶点。单细胞TCR测序技术特别有助于分析T细胞克隆动态、分化以及反应轨迹,为研究健康和疾病状态下T细胞反应提供了重要信息。
3、免疫组库测序是一种同时获取V(D)J区段全长序列和5’端转录组信息的方法,主要应用于BCR(B细胞受体)和TCR(T细胞受体)的测序。BCR和TCR由两条重链和两条轻链组成,分别位于B细胞和T细胞表面,用于识别并特异性结合抗原。
4、研究团队使用单细胞测序技术深入解析了非淋巴组织驻留的Treg细胞,颠覆了过去认为它们具有组织限制性的认知。实验发现,不同组织驻留的Treg细胞具有相似的表型和T细胞受体(TCR)库,这使得它们具有多组织迁移的能力,仅在组织短暂驻留,且无组织特异性。
国际免疫遗传学数据库(IMGT)是分析抗原受体、免疫球蛋白(抗体)基因以及T细胞受体的宝贵资源,整理了从鱼类到人类等颌骨脊椎动物的适应性免疫库。数据库提供对IG和TR的V、D、J和C基因的详细记录,为免疫组库研究提供了基础。
准确灵敏实验系统基于无偏Ig/TCR多重PCR,通过持续研发实验技术及数据处理算法,优化引物扩增效率,确保MRD定量的高准确度和高灵敏度。实验体系包括IGH、IGK、IGL、TRB、TRD、TRG的受体链,准确鉴定肿瘤细胞标志序列,有效避免肿瘤细胞突变导致的假阴性或定量不准确。